Ich finde das meine Northbridge unter Normal Bediegung ziemlich warm wird, wollte mal fragen ob man ein Mainboard während das System läuft runter und auch wieder hoch Takten kann?

Das Board selbst kannst du kaum 'vertakten'. Das geht nur über den Systemtakt für die Speicher und den Prozessor. Ist aber das falsche Ende. Verbessere die Durchlüftung des Gehäuses, wenn die Taktraten im Sollbereich liegen.

Ein etwas stärkerer Lüfter kann helfen. Manchmal reicht es sogar, mal im Gehäuse zu entstauben, damit die Lüfter wieder ordentlich durchblasen können.